水稻基因组项目完成后，2002年4月，另一本世界顶级刊物《科学》杂志 以14页的篇幅发表了《水稻f(和lJ稻)基因组工作框架序列图}，并配以大量的评论文章，高度评价该工作是对世界科学乃至全人类里程碑式的贡献。这次，邓亚军的名字和个人专访也出现在《科学》杂志上。

文章一发表，在国内再度引起关注，很多媒体记者与华大方面联系，希望能采访邓亚军，但让人意外的是，这时谁都联系不上她一一原来此时她已经返回西安，准备自己的论文答辩去了。

没错，这时的邓亚军，尽管已经经过两大重点项目的锤炼，但尚未获得硕士18 文凭。以一个在读硕士的条件，在这么大的项目中担任主管，在中国这样一个讲-求资历与背景的环境下，需要面对的挑战和背后的辛苦，就只有她自己才能体会了。

经过这两年在北京的摸爬滚打后，继续攻读博士学位、在DNA鉴定领域走得更远也是邓亚军给自己定下的目标，在顺利拿到硕士文凭后，她又获得西安医科大学的博士录取资格，然而这次她的工作单位濡桥分局却没有再支持她。

在2002年的西安市公安局濡桥分局，硕士毕业的邓亚军已经算是分局学历最高的警察。参加完超级杂交稻基因组计划后，中央电视台采访了邓亚军，这期采访播出后在濡桥分局引起了不小的震动，分局的同事谁也没有想到当初那个看上去风风火火的小姑娘，不仅能做好法医的事，还能参与到这么尖端的国际项目中去。