亲子鉴定样本一般是越早送检越好，保质时间的长短与样本量的多少和保存方式有关系。样本量越多，保存时间就越长，相对样本损失的比例越小；一般都要求样本透气或是阴干保存，若捂住，因生物检材一般都含有水分，时间长了会有细菌滋生，使样本产生霉变，霉变会使DNA降解。有霉斑的样本或是有恶臭的样本一般亲子鉴定中心是不接收的。
血痕、毛发、指甲做亲子鉴定只要能顺利得到样本中人的DNA准确性都是一样的。其三者的DNA含量血痕大于毛发，毛发大于指甲，因此样本保存时间血痕是最长的。血痕样本如果处理得到，可以长时间保存。
血痕、毛发、指甲等亲子鉴定样本，一般把血痕、毛发划分为常规样本，指甲为特殊样本。其主要是在实验的DNA提取的过程中，指甲提取DNA提取的较难一些，处理的时间也相对较长一些。但是在隐私亲子鉴定中，指甲是最常见的样本，常被需要在部分被鉴定人不知情的情况下，能采集到的不错的样本选择。因指甲提取DNA的概率还是不错，高达95%左右。毛发样本做为亲子鉴定样本一般是需要对供体年龄有一定的要求，如五岁以上。血痕是亲子鉴定中使用得最多的样本了，也有部分人认为血痕是最准确的，其实血痕只是做实验的时候容易一些，且血痕样本含的人体的细胞相对比较多，一般都是能较快成功提取样本的DNA，也是司法亲子鉴定样本的选择。
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