亲子鉴定中在对人类遗传基因座检测分析两者间的亲子关系时，三个以上不符合遗传规律的才能判定为非亲生关系的。
当亲子鉴定判定亲子关系时一个位点不符合遗传规律的，一般是需要加做母亲的样本做父母子三联体亲子鉴定，或父子两人同时增加检测到40位点来进一步确认亲子关系。一般加测后都是亲生关系的。如果一个位点对不上是非亲生的话，那么这两个人一定是近亲了。在亲子鉴定判定亲子关系时，是需要在排除同卵多胞胎、近亲及外源干扰的前提下，做最后的判定。所以在亲子鉴定时，都是否定的是100%排除亲子关系，肯定的是亲权概率大于99.99%的判定亲子关系，肯定理论上无法达到100%的，只是无限接近100%，肯定的达到100%判定的前提条件是假定父、假定子的两个人需要排除特殊情况。

亲子鉴定中结果是亲子关系的绝大多数情况下，是所有位点都符合遗传规律的，但是为何会有一个基因座位点不符合遗传规律的呢？这种现象在遗传学上被认为是基因突变。基因突变一般都是外界环境的影响才发生的。在判定基因突变的时，在亲子鉴定中若某一个基因座位点发生突变时，大部分某个基因座位点在遗传过程中发生一个碱基的增加或减少，特殊情况在遗传过程中发生两个碱基的增加或减少，两个碱基的增加或减少就已经很罕见，超过两个的或是更多的就很难发生。所有轻微的突变是存在的，如果碱基重复数相差很大，那就不是基因突变现象，那就是不符合遗传规律的。

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