亲子鉴定一般应当以双方自愿为原则，不能申请强制鉴定。
未成人是有权利拒绝做亲子鉴定，同时也有义务配合司法机关做亲子鉴定。即使是成年人也是有权利拒绝的。不过亲子鉴定更多的是保护未成年人的权益的。通过亲子鉴定是可以让未成年人特别是非婚子享有与婚生子同等的权益。
做司法亲子鉴定是需要年满18周后具有完全行事能力的合法公民才行的，未成年人是需要在成年人的监护条件进行的，未成年人是无权委托做亲子鉴定。在司法亲子鉴定委托书的内容是需要成年人亲笔填写并按指纹的。

因此，未成年拒绝不拒绝司法机关的亲子鉴定跟司法亲子鉴定机构一点关系都没有。只跟是否要求参与鉴定的父亲或母亲是有关系的。亲子鉴定一般都是属于民事纠纷，亲子鉴定机构作为第三方独立于法庭外的只是负责司法亲子鉴定技术上取证验证的过程，对任何人都是公平公正的，都是以科学技术来分析问题。而不得参与任何民事纠纷。他只是法律上一个科学公正的辅助技术管理部门。他的技术鉴定上都是盲测，采集取证样本人员只需要负责样本、样本来源、被鉴定人的身份信息一一对应即可，实验人员只负责样本的鉴定检测规范，审核人员审核资料，司法被鉴定人的照片和有效证件是否一一对应。各个环节独立操作，各行其责。保证司法鉴定的严格准确无误。

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