男方或女方单方的司法亲子鉴定和男女双方的司法亲子鉴定都是有效的。
一般司法亲子鉴定是父母子三方的事，但是参与做司法亲子鉴定可以是父子或母子的二联体的单亲亲子鉴定，也可以做父母子三联体的亲子鉴定。
法律面前人人平等。所以做司法的单亲亲子鉴定时，因忽略了另一方的权利的时候，未参与方是有权不承认的。且可以不承认单亲的司法亲子鉴定报告和结论。
但是在有单亲的司法亲子鉴定时，不承认的一方不承认该单亲司法亲子鉴定时，是需要做父母子三人的司法亲子鉴定的，如果拒绝做，那一般会支持现有的单亲亲子鉴定主张成立。如果没有司法亲子鉴定，就得是现有的法律上的关系，婚生子就是亲生的，非婚子就是非亲生的。

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