亲子鉴定是STR分型检测（即DNA检测）技术在生活中的应用。该技术目前成熟稳定，对于人个体来说，每人一个的STR分型数据除了同卵多胞胎是相同的其他的所有人都是不相同的。
两份亲子鉴定结果不一样一般应该是不同人的，也就是看看两份报告上面检测出来的个体的DNA数据，如果数据一样结果不相同，那就是分析两者间的亲子关系其中一份有误，如果数据不一样，结果肯定是不一样的。也就是两份亲子鉴定检测的不是两个人，可能是三个人或是四个人。

如果是做司法亲子鉴定，是需要当事人在场并提供有效证件。样本都是有鉴定中心的工作人员亲自采集样本。不可能出现结果不一样的情况。如果出现就是有错误就是鉴定有误的现象了。人是为还是操作呢？在亲子鉴定技术试验操作上，标准都是盲测的。就是采样人员只负责把样本做好相应的标记，实验人员都是根据标记分析两者间的亲子关系。而且实验也是平行实验，亲子鉴定行业的标准文件亲权鉴定技术标准在拟定的过程中肯定是把可能犯的误差都会考虑进去。特别是正规的国有实验室在亲子鉴定验证实验中连人的身份试剂盒都会考虑用国内外不同的种的产品去验证。所以说亲子鉴定的实验操作误差性很小，对亲子鉴定结果的判定也是很难有发生。